Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CYP4F3Q08477 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYP4F3Q08477 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms