Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
GOLGA3Q08378 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC35■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
GOLGA3Q08378 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms