Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LRP1Q07954 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LRP1Q07954 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms