Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CXCL9Q07325 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CXCL9Q07325 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CXCL9Q07325 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms