Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GABPAQ06546 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms