Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPN11Q06124 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPN11Q06124 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms