Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CTDSPL2Q05D32 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDSPL2Q05D32 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms