Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PRKCDQ05655 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PRKCDQ05655 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms