Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIN1Q05586 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIN1Q05586 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms