Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CD164Q04900 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CD164Q04900 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CD164Q04900 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CD164Q04900 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms