Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	BUD27	YFL023W	2391 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	PRM15	YMR278W	1869 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	RRP14	YKL082C	1305 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	YPR148C	YPR148C	1308 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	TAF6	YGL112C	1551 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	RPL35B	YDL136W	363 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	RNH202	YDR279W	1053 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	PPE1	YHR075C	1203 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	AIR1	YIL079C	1083 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	SIC1	YLR079W	855 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	APC9	YLR102C	798 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	YPT7	YML001W	627 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	YMR316C-A	YMR316C-A	312 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	TIR2	YOR010C	756 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	YPR074W-A	YPR074W-A	171 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	TED1	YIL039W	1422 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SYF1	Q04048	IMH1	YLR309C	2736 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	IMD4	YML056C	1575 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	NRP1	YDL167C	2160 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	PRP11	YDL043C	801 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	NKP1	YDR383C	717 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	EAF7	YNL136W	1278 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	APE2	YKL157W	2859 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	SEG1	YMR086W	2883 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	VAS1	YGR094W	3315 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	YOR365C	YOR365C	2112 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	ELM1	YKL048C	1923 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	EMC1	YCL045C	2283 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	ACK1	YDL203C	1872 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	ABP140	YOR239W	1887 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	RRG1	YDR065W	1098 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	ERJ5	YFR041C	888 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	YPT35	YHR105W	645 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	YLL047W	YLL047W	384 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	POP8	YBL018C	402 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	YNL035C	YNL035C	1170 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	SSP2	YOR242C	1116 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	DBP5	YOR046C	1449 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	PLM2	YDR501W	1566 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	ECM16	YMR128W	3804 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	ERB1	YMR049C	2424 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	GPI10	YGL142C	1851 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	SRP40	YKR092C	1221 nt		4	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	IES3	YLR052W	753 nt		4	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	YMR310C	YMR310C	954 nt		4	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	LDH1	YBR204C	1128 nt		4	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	YOL019W	YOL019W	1656 nt		4	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	YPL109C	YPL109C	1974 nt		4	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	MAL12	YGR292W	1755 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	MAL32	YBR299W	1755 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	NEM1	YHR004C	1341 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	DSS1	YMR287C	2910 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	APN2	YBL019W	1563 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	FAD1	YDL045C	921 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	SEC53	YFL045C	765 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	PCL7	YIL050W	858 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	YIR014W	YIR014W	729 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	YAL004W	YAL004W	648 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	RIM11	YMR139W	1113 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	GYP6	YJL044C	1377 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	MLH2	YLR035C	2088 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	NSA2	YER126C	786 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	CDC26	YFR036W	375 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	YGL006W-A	YGL006W-A	111 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	tV(CAC)D	tV(CAC)D	73 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	tV(CAC)H	tV(CAC)H	73 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	YJR056C	YJR056C	711 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	FIP1	YJR093C	984 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	YML047W-A	YML047W-A	366 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	MRPL16	YBL038W	699 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	IZH4	YOL101C	939 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	PFK27	YOL136C	1194 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	SUR1	YPL057C	1149 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	ATG5	YPL149W	885 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	ARA1	YBR149W	1035 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	UBS1	YBR165W	834 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	FUN12	YAL035W	3009 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	NUF2	YOL069W	1356 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	GPI1	YGR216C	1830 nt		3.98	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	YGL140C	YGL140C	3660 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	YTA7	YGR270W	4140 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	TRP4	YDR354W	1143 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	YGR107W	YGR107W	450 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	YLR012C	YLR012C	300 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	INN1	YNL152W	1230 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	YNL171C	YNL171C	369 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	RRG9	YNL213C	645 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	ZDS1	YMR273C	2748 nt		3.97	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	MSS4	YDR208W	2340 nt		3.96	□□□□□ -1.77
SYF1	Q04048	MIC60	YKR016W	1623 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	YCR024C-B	YCR024C-B	267 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	snR78	snR78	87 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	YIL102C-A	YIL102C-A	228 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	IRC18	YJL037W	675 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	SAW1	YAL027W	786 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	YAL064W-B	YAL064W-B	381 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	OCA2	YNL056W	594 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	HNT3	YOR258W	654 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	DIB1	YPR082C	432 nt		3.96	□□□□□ -1.78
SYF1	Q04048	snR42	snR42	351 nt		3.96	□□□□□ -1.78

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