Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH6A1Q02252 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH6A1Q02252 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH6A1Q02252 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH6A1Q02252 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH6A1Q02252 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH6A1Q02252 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH6A1Q02252 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH6A1Q02252 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH6A1Q02252 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH6A1Q02252 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALDH6A1Q02252 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms