Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2F1Q01094 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2F1Q01094 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms