Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDK5Q00535 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDK5Q00535 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms