Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM3AP98173 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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