Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERVK_113P63132 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms