Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P62891 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P62891 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P62891 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P62891 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P62891 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P62891 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL39P62891 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P62891 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P62891 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P62891 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P62891 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P62891 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P62891 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P62891 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P62891 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P62891 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P62891 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P62891 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P62891 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P62891 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P62891 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P62891 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P62891 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL39P62891 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P62891 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P62891 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P62891 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P62891 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P62891 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P62891 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P62891 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P62891 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P62891 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P62891 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P62891 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P62891 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P62891 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P62891 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P62891 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P62891 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPL39P62891 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P62891 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P62891 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P62891 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P62891 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P62891 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P62891 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P62891 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P62891 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P62891 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P62891 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P62891 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P62891 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P62891 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P62891 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P62891 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P62891 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P62891 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P62891 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P62891 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPL39P62891 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P62891 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P62891 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P62891 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P62891 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P62891 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P62891 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P62891 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P62891 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P62891 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P62891 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P62891 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P62891 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P62891 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P62891 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P62891 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P62891 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPL39P62891 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms