Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GNB1P62873 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GNB1P62873 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GNB1P62873 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GNB1P62873 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB1P62873 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB1P62873 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB1P62873 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB1P62873 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB1P62873 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB1P62873 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB1P62873 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB1P62873 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB1P62873 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB1P62873 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB1P62873 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB1P62873 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB1P62873 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB1P62873 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB1P62873 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GNB1P62873 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB1P62873 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB1P62873 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB1P62873 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB1P62873 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB1P62873 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB1P62873 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB1P62873 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB1P62873 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB1P62873 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB1P62873 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB1P62873 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB1P62873 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB1P62873 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB1P62873 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB1P62873 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB1P62873 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GNB1P62873 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GNB1P62873 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms