Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSNL1P62760 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VSNL1P62760 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms