Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2HP62256 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2HP62256 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms