Protein–RNA interactions for Protein: P61812

TGFB2, Transforming growth factor beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB2P61812 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TGFB2P61812 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TGFB2P61812 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TGFB2P61812 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TGFB2P61812 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TGFB2P61812 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TGFB2P61812 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TGFB2P61812 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TGFB2P61812 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TGFB2P61812 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TGFB2P61812 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TGFB2P61812 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TGFB2P61812 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TGFB2P61812 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TGFB2P61812 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TGFB2P61812 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TGFB2P61812 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TGFB2P61812 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TGFB2P61812 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TGFB2P61812 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TGFB2P61812 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TGFB2P61812 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms