Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVS71-1P61550 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms