Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms