Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1-1P60608 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms