Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EEFSECP57772 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEFSECP57772 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms