Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NAP1L1P55209 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NAP1L1P55209 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms