Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELLP55199 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELLP55199 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELLP55199 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELLP55199 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELLP55199 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELLP55199 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELLP55199 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELLP55199 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELLP55199 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELLP55199 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELLP55199 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELLP55199 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELLP55199 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELLP55199 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELLP55199 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELLP55199 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELLP55199 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELLP55199 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELLP55199 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELLP55199 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELLP55199 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELLP55199 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELLP55199 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELLP55199 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELLP55199 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELLP55199 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELLP55199 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELLP55199 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELLP55199 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELLP55199 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELLP55199 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ELLP55199 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ELLP55199 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELLP55199 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELLP55199 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELLP55199 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELLP55199 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELLP55199 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELLP55199 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELLP55199 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELLP55199 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELLP55199 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELLP55199 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELLP55199 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELLP55199 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELLP55199 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELLP55199 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELLP55199 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELLP55199 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELLP55199 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELLP55199 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELLP55199 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELLP55199 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELLP55199 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELLP55199 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELLP55199 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELLP55199 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELLP55199 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELLP55199 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELLP55199 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELLP55199 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELLP55199 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELLP55199 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELLP55199 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ELLP55199 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELLP55199 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ELLP55199 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ELLP55199 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ELLP55199 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ELLP55199 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELLP55199 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELLP55199 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELLP55199 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELLP55199 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELLP55199 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELLP55199 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELLP55199 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms