Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMTNP53814 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMTNP53814 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMTNP53814 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMTNP53814 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMTNP53814 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMTNP53814 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMTNP53814 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMTNP53814 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMTNP53814 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMTNP53814 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMTNP53814 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMTNP53814 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMTNP53814 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMTNP53814 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMTNP53814 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMTNP53814 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMTNP53814 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMTNP53814 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMTNP53814 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMTNP53814 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMTNP53814 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMTNP53814 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SMTNP53814 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMTNP53814 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMTNP53814 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMTNP53814 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMTNP53814 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMTNP53814 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMTNP53814 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMTNP53814 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMTNP53814 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMTNP53814 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMTNP53814 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMTNP53814 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMTNP53814 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMTNP53814 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMTNP53814 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMTNP53814 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMTNP53814 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMTNP53814 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMTNP53814 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SMTNP53814 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMTNP53814 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMTNP53814 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMTNP53814 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMTNP53814 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMTNP53814 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMTNP53814 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMTNP53814 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMTNP53814 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMTNP53814 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMTNP53814 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMTNP53814 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SMTNP53814 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMTNP53814 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMTNP53814 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMTNP53814 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMTNP53814 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMTNP53814 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMTNP53814 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SMTNP53814 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMTNP53814 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMTNP53814 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SMTNP53814 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMTNP53814 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMTNP53814 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMTNP53814 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMTNP53814 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMTNP53814 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMTNP53814 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMTNP53814 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMTNP53814 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMTNP53814 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMTNP53814 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMTNP53814 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SMTNP53814 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMTNP53814 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMTNP53814 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMTNP53814 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMTNP53814 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMTNP53814 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMTNP53814 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMTNP53814 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMTNP53814 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMTNP53814 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMTNP53814 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMTNP53814 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMTNP53814 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMTNP53814 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMTNP53814 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMTNP53814 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMTNP53814 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMTNP53814 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMTNP53814 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMTNP53814 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMTNP53814 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMTNP53814 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMTNP53814 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMTNP53814 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms