Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST1P52848 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST1P52848 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST1P52848 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST1P52848 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST1P52848 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST1P52848 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST1P52848 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST1P52848 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST1P52848 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDST1P52848 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST1P52848 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST1P52848 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST1P52848 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST1P52848 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST1P52848 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST1P52848 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST1P52848 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST1P52848 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST1P52848 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST1P52848 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST1P52848 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST1P52848 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST1P52848 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDST1P52848 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDST1P52848 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDST1P52848 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDST1P52848 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDST1P52848 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDST1P52848 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDST1P52848 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDST1P52848 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDST1P52848 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDST1P52848 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDST1P52848 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDST1P52848 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDST1P52848 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDST1P52848 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDST1P52848 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDST1P52848 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDST1P52848 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDST1P52848 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDST1P52848 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDST1P52848 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDST1P52848 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDST1P52848 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDST1P52848 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDST1P52848 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDST1P52848 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDST1P52848 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDST1P52848 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDST1P52848 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NDST1P52848 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDST1P52848 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDST1P52848 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NDST1P52848 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDST1P52848 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDST1P52848 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDST1P52848 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDST1P52848 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDST1P52848 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDST1P52848 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDST1P52848 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDST1P52848 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDST1P52848 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDST1P52848 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDST1P52848 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDST1P52848 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDST1P52848 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDST1P52848 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDST1P52848 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDST1P52848 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDST1P52848 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDST1P52848 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDST1P52848 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDST1P52848 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDST1P52848 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDST1P52848 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDST1P52848 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms