Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERFP50548 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERFP50548 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ERFP50548 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERFP50548 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERFP50548 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERFP50548 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERFP50548 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERFP50548 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERFP50548 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERFP50548 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERFP50548 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ERFP50548 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERFP50548 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERFP50548 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERFP50548 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERFP50548 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERFP50548 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERFP50548 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERFP50548 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERFP50548 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERFP50548 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ERFP50548 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERFP50548 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERFP50548 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERFP50548 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERFP50548 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERFP50548 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERFP50548 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERFP50548 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERFP50548 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERFP50548 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERFP50548 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERFP50548 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERFP50548 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERFP50548 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERFP50548 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERFP50548 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERFP50548 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERFP50548 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERFP50548 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERFP50548 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERFP50548 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERFP50548 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERFP50548 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERFP50548 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERFP50548 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERFP50548 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERFP50548 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERFP50548 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERFP50548 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERFP50548 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERFP50548 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERFP50548 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERFP50548 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERFP50548 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERFP50548 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERFP50548 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERFP50548 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERFP50548 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERFP50548 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERFP50548 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERFP50548 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERFP50548 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERFP50548 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERFP50548 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERFP50548 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERFP50548 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERFP50548 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERFP50548 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERFP50548 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERFP50548 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERFP50548 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERFP50548 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERFP50548 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERFP50548 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERFP50548 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERFP50548 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERFP50548 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERFP50548 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERFP50548 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERFP50548 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERFP50548 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERFP50548 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERFP50548 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERFP50548 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERFP50548 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERFP50548 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERFP50548 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERFP50548 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERFP50548 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERFP50548 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERFP50548 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERFP50548 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERFP50548 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERFP50548 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERFP50548 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERFP50548 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERFP50548 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ERFP50548 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms