Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTPAP49638 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTPAP49638 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTPAP49638 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTPAP49638 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTPAP49638 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTPAP49638 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTPAP49638 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTPAP49638 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTPAP49638 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTPAP49638 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTPAP49638 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTPAP49638 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTPAP49638 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTPAP49638 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTPAP49638 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTPAP49638 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTPAP49638 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTPAP49638 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTPAP49638 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTPAP49638 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTPAP49638 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTPAP49638 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTPAP49638 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTPAP49638 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTPAP49638 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTPAP49638 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTPAP49638 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTPAP49638 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTPAP49638 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTPAP49638 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TTPAP49638 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TTPAP49638 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TTPAP49638 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTPAP49638 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTPAP49638 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TTPAP49638 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TTPAP49638 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTPAP49638 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTPAP49638 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTPAP49638 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTPAP49638 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TTPAP49638 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTPAP49638 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTPAP49638 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTPAP49638 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTPAP49638 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TTPAP49638 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTPAP49638 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTPAP49638 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTPAP49638 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTPAP49638 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTPAP49638 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTPAP49638 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTPAP49638 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTPAP49638 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTPAP49638 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTPAP49638 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTPAP49638 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TTPAP49638 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TTPAP49638 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTPAP49638 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTPAP49638 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTPAP49638 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTPAP49638 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTPAP49638 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTPAP49638 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTPAP49638 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TTPAP49638 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTPAP49638 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TTPAP49638 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTPAP49638 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTPAP49638 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTPAP49638 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTPAP49638 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTPAP49638 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTPAP49638 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTPAP49638 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTPAP49638 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTPAP49638 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTPAP49638 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTPAP49638 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTPAP49638 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTPAP49638 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTPAP49638 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTPAP49638 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTPAP49638 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTPAP49638 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TTPAP49638 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTPAP49638 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTPAP49638 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTPAP49638 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTPAP49638 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTPAP49638 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTPAP49638 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TTPAP49638 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTPAP49638 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTPAP49638 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTPAP49638 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTPAP49638 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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