Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
AMPHP49418 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
AMPHP49418 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMPHP49418 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMPHP49418 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMPHP49418 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
AMPHP49418 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMPHP49418 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
AMPHP49418 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMPHP49418 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMPHP49418 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AMPHP49418 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AMPHP49418 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AMPHP49418 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
AMPHP49418 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AMPHP49418 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
AMPHP49418 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AMPHP49418 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
AMPHP49418 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AMPHP49418 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AMPHP49418 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AMPHP49418 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AMPHP49418 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMPHP49418 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMPHP49418 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMPHP49418 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
AMPHP49418 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMPHP49418 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMPHP49418 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMPHP49418 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
AMPHP49418 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMPHP49418 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMPHP49418 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AMPHP49418 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
AMPHP49418 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AMPHP49418 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AMPHP49418 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AMPHP49418 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AMPHP49418 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
AMPHP49418 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AMPHP49418 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AMPHP49418 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AMPHP49418 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AMPHP49418 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AMPHP49418 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AMPHP49418 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AMPHP49418 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AMPHP49418 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AMPHP49418 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
AMPHP49418 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AMPHP49418 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AMPHP49418 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AMPHP49418 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AMPHP49418 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AMPHP49418 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AMPHP49418 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AMPHP49418 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AMPHP49418 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AMPHP49418 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AMPHP49418 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AMPHP49418 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AMPHP49418 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AMPHP49418 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AMPHP49418 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AMPHP49418 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AMPHP49418 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AMPHP49418 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AMPHP49418 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
AMPHP49418 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AMPHP49418 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AMPHP49418 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AMPHP49418 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
AMPHP49418 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AMPHP49418 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AMPHP49418 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AMPHP49418 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AMPHP49418 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AMPHP49418 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AMPHP49418 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AMPHP49418 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AMPHP49418 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AMPHP49418 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AMPHP49418 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AMPHP49418 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AMPHP49418 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
AMPHP49418 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AMPHP49418 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AMPHP49418 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
AMPHP49418 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
AMPHP49418 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AMPHP49418 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
AMPHP49418 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AMPHP49418 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AMPHP49418 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
AMPHP49418 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
AMPHP49418 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AMPHP49418 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
AMPHP49418 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
AMPHP49418 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
AMPHP49418 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms