Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PITPNBP48739 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PITPNBP48739 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms