Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSSP48449 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSSP48449 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSSP48449 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSSP48449 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSSP48449 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSSP48449 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSSP48449 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LSSP48449 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
LSSP48449 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSSP48449 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSSP48449 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSSP48449 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSSP48449 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSSP48449 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSSP48449 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSSP48449 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LSSP48449 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSSP48449 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSSP48449 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSSP48449 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSSP48449 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSSP48449 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSSP48449 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LSSP48449 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LSSP48449 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LSSP48449 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSSP48449 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSSP48449 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSSP48449 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSSP48449 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSSP48449 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LSSP48449 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSSP48449 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSSP48449 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSSP48449 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSSP48449 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSSP48449 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSSP48449 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSSP48449 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSSP48449 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSSP48449 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSSP48449 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSSP48449 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LSSP48449 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LSSP48449 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSSP48449 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSSP48449 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSSP48449 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSSP48449 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSSP48449 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSSP48449 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSSP48449 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSSP48449 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSSP48449 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LSSP48449 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSSP48449 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LSSP48449 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LSSP48449 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LSSP48449 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LSSP48449 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSSP48449 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSSP48449 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSSP48449 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSSP48449 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSSP48449 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LSSP48449 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSSP48449 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSSP48449 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSSP48449 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSSP48449 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSSP48449 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSSP48449 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
LSSP48449 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LSSP48449 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSSP48449 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSSP48449 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSSP48449 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSSP48449 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSSP48449 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSSP48449 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSSP48449 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSSP48449 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSSP48449 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LSSP48449 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSSP48449 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSSP48449 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSSP48449 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSSP48449 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSSP48449 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSSP48449 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSSP48449 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LSSP48449 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSSP48449 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LSSP48449 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSSP48449 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSSP48449 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSSP48449 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LSSP48449 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LSSP48449 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms