Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RXRGP48443 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RXRGP48443 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RXRGP48443 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RXRGP48443 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RXRGP48443 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RXRGP48443 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RXRGP48443 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RXRGP48443 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RXRGP48443 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RXRGP48443 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RXRGP48443 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RXRGP48443 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RXRGP48443 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RXRGP48443 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRGP48443 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRGP48443 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRGP48443 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRGP48443 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRGP48443 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRGP48443 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRGP48443 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRGP48443 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRGP48443 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRGP48443 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRGP48443 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRGP48443 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRGP48443 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRGP48443 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRGP48443 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRGP48443 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RXRGP48443 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RXRGP48443 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RXRGP48443 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RXRGP48443 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRGP48443 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRGP48443 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRGP48443 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRGP48443 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRGP48443 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRGP48443 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRGP48443 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRGP48443 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RXRGP48443 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRGP48443 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRGP48443 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRGP48443 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRGP48443 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRGP48443 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRGP48443 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRGP48443 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRGP48443 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRGP48443 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRGP48443 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRGP48443 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRGP48443 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRGP48443 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRGP48443 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRGP48443 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRGP48443 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRGP48443 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RXRGP48443 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRGP48443 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRGP48443 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRGP48443 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRGP48443 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRGP48443 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRGP48443 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRGP48443 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRGP48443 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRGP48443 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRGP48443 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRGP48443 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRGP48443 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRGP48443 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRGP48443 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRGP48443 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRGP48443 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRGP48443 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RXRGP48443 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RXRGP48443 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RXRGP48443 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RXRGP48443 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RXRGP48443 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RXRGP48443 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RXRGP48443 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RXRGP48443 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RXRGP48443 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RXRGP48443 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RXRGP48443 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RXRGP48443 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RXRGP48443 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RXRGP48443 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RXRGP48443 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RXRGP48443 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RXRGP48443 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RXRGP48443 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RXRGP48443 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RXRGP48443 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RXRGP48443 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms