Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL21P46778 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL21P46778 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL21P46778 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL21P46778 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL21P46778 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL21P46778 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL21P46778 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL21P46778 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL21P46778 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL21P46778 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL21P46778 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL21P46778 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL21P46778 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL21P46778 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL21P46778 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL21P46778 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL21P46778 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL21P46778 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL21P46778 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL21P46778 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL21P46778 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL21P46778 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL21P46778 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL21P46778 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL21P46778 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL21P46778 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL21P46778 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL21P46778 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL21P46778 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL21P46778 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL21P46778 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL21P46778 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL21P46778 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL21P46778 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL21P46778 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL21P46778 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL21P46778 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL21P46778 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL21P46778 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL21P46778 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL21P46778 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL21P46778 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL21P46778 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL21P46778 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL21P46778 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL21P46778 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL21P46778 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL21P46778 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL21P46778 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL21P46778 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL21P46778 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL21P46778 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL21P46778 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL21P46778 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL21P46778 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL21P46778 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL21P46778 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL21P46778 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL21P46778 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL21P46778 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPL21P46778 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPL21P46778 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPL21P46778 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPL21P46778 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL21P46778 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL21P46778 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL21P46778 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL21P46778 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL21P46778 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL21P46778 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL21P46778 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL21P46778 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL21P46778 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL21P46778 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL21P46778 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL21P46778 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL21P46778 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL21P46778 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL21P46778 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL21P46778 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL21P46778 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL21P46778 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL21P46778 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL21P46778 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL21P46778 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL21P46778 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL21P46778 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL21P46778 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL21P46778 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL21P46778 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL21P46778 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL21P46778 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL21P46778 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL21P46778 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL21P46778 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL21P46778 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL21P46778 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL21P46778 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL21P46778 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms