Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACADSBP45954 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACADSBP45954 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACADSBP45954 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms