Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRIA2P42262 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIA2P42262 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIA2P42262 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GRIA2P42262 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA2P42262 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA2P42262 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA2P42262 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA2P42262 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRIA2P42262 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms