Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJC1P36383 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJC1P36383 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJC1P36383 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJC1P36383 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJC1P36383 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJC1P36383 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJC1P36383 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJC1P36383 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJC1P36383 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJC1P36383 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJC1P36383 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJC1P36383 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJC1P36383 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJC1P36383 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJC1P36383 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJC1P36383 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GJC1P36383 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJC1P36383 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJC1P36383 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJC1P36383 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJC1P36383 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJC1P36383 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJC1P36383 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GJC1P36383 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJC1P36383 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJC1P36383 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJC1P36383 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJC1P36383 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJC1P36383 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJC1P36383 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJC1P36383 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJC1P36383 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJC1P36383 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJC1P36383 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJC1P36383 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJC1P36383 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJC1P36383 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJC1P36383 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJC1P36383 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJC1P36383 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJC1P36383 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJC1P36383 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJC1P36383 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJC1P36383 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJC1P36383 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJC1P36383 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJC1P36383 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJC1P36383 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJC1P36383 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJC1P36383 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJC1P36383 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJC1P36383 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJC1P36383 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJC1P36383 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJC1P36383 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJC1P36383 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJC1P36383 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJC1P36383 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJC1P36383 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJC1P36383 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJC1P36383 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJC1P36383 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GJC1P36383 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GJC1P36383 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJC1P36383 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJC1P36383 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJC1P36383 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJC1P36383 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJC1P36383 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJC1P36383 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJC1P36383 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJC1P36383 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJC1P36383 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJC1P36383 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJC1P36383 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJC1P36383 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJC1P36383 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GJC1P36383 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJC1P36383 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJC1P36383 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJC1P36383 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJC1P36383 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJC1P36383 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJC1P36383 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJC1P36383 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJC1P36383 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJC1P36383 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJC1P36383 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJC1P36383 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJC1P36383 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJC1P36383 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJC1P36383 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJC1P36383 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GJC1P36383 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJC1P36383 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJC1P36383 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJC1P36383 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJC1P36383 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJC1P36383 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms