Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP6P35125 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP6P35125 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP6P35125 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP6P35125 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP6P35125 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP6P35125 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP6P35125 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
USP6P35125 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP6P35125 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP6P35125 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
USP6P35125 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
USP6P35125 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP6P35125 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP6P35125 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP6P35125 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP6P35125 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP6P35125 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP6P35125 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP6P35125 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
USP6P35125 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP6P35125 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP6P35125 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
USP6P35125 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP6P35125 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP6P35125 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP6P35125 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP6P35125 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP6P35125 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
USP6P35125 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP6P35125 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP6P35125 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP6P35125 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP6P35125 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP6P35125 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP6P35125 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP6P35125 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP6P35125 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
USP6P35125 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP6P35125 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP6P35125 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP6P35125 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
USP6P35125 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP6P35125 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP6P35125 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP6P35125 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP6P35125 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP6P35125 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP6P35125 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP6P35125 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP6P35125 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
USP6P35125 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP6P35125 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
USP6P35125 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP6P35125 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP6P35125 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP6P35125 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP6P35125 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP6P35125 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP6P35125 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP6P35125 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP6P35125 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP6P35125 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP6P35125 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP6P35125 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP6P35125 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP6P35125 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP6P35125 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP6P35125 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP6P35125 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
USP6P35125 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP6P35125 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
USP6P35125 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP6P35125 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP6P35125 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP6P35125 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP6P35125 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP6P35125 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
USP6P35125 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP6P35125 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP6P35125 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP6P35125 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP6P35125 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP6P35125 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP6P35125 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP6P35125 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP6P35125 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP6P35125 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP6P35125 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP6P35125 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP6P35125 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP6P35125 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP6P35125 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP6P35125 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP6P35125 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP6P35125 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP6P35125 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP6P35125 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP6P35125 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
USP6P35125 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms