Protein–RNA interactions for Protein: P33991

MCM4, DNA replication licensing factor MCM4, humanhuman

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM4P33991 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM4P33991 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM4P33991 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM4P33991 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM4P33991 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM4P33991 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM4P33991 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM4P33991 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM4P33991 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM4P33991 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM4P33991 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM4P33991 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MCM4P33991 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM4P33991 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM4P33991 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM4P33991 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM4P33991 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM4P33991 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM4P33991 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM4P33991 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM4P33991 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM4P33991 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM4P33991 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM4P33991 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM4P33991 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCM4P33991 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM4P33991 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM4P33991 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM4P33991 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM4P33991 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM4P33991 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM4P33991 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM4P33991 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM4P33991 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM4P33991 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM4P33991 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM4P33991 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCM4P33991 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM4P33991 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM4P33991 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM4P33991 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM4P33991 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM4P33991 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM4P33991 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCM4P33991 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCM4P33991 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCM4P33991 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM4P33991 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM4P33991 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM4P33991 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM4P33991 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM4P33991 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCM4P33991 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM4P33991 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM4P33991 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM4P33991 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM4P33991 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM4P33991 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM4P33991 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM4P33991 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM4P33991 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM4P33991 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM4P33991 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM4P33991 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCM4P33991 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM4P33991 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM4P33991 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM4P33991 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM4P33991 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM4P33991 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM4P33991 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM4P33991 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM4P33991 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM4P33991 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM4P33991 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM4P33991 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM4P33991 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM4P33991 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM4P33991 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MCM4P33991 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM4P33991 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM4P33991 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM4P33991 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM4P33991 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM4P33991 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM4P33991 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM4P33991 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM4P33991 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM4P33991 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM4P33991 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCM4P33991 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM4P33991 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM4P33991 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM4P33991 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM4P33991 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM4P33991 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM4P33991 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM4P33991 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM4P33991 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCM4P33991 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms