Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP1P32455 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP1P32455 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP1P32455 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP1P32455 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP1P32455 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP1P32455 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP1P32455 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP1P32455 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP1P32455 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP1P32455 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP1P32455 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP1P32455 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP1P32455 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP1P32455 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP1P32455 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP1P32455 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP1P32455 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP1P32455 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP1P32455 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP1P32455 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP1P32455 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP1P32455 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP1P32455 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP1P32455 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP1P32455 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP1P32455 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP1P32455 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP1P32455 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP1P32455 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP1P32455 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP1P32455 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP1P32455 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP1P32455 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP1P32455 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP1P32455 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP1P32455 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP1P32455 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP1P32455 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP1P32455 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP1P32455 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP1P32455 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP1P32455 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP1P32455 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP1P32455 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP1P32455 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP1P32455 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP1P32455 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP1P32455 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP1P32455 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP1P32455 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP1P32455 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP1P32455 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP1P32455 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP1P32455 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP1P32455 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP1P32455 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP1P32455 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP1P32455 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP1P32455 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP1P32455 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP1P32455 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP1P32455 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP1P32455 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP1P32455 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP1P32455 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP1P32455 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP1P32455 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP1P32455 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP1P32455 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP1P32455 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP1P32455 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP1P32455 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP1P32455 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP1P32455 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP1P32455 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GBP1P32455 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GBP1P32455 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GBP1P32455 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP1P32455 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP1P32455 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP1P32455 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP1P32455 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP1P32455 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP1P32455 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP1P32455 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP1P32455 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP1P32455 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP1P32455 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP1P32455 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP1P32455 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP1P32455 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP1P32455 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP1P32455 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP1P32455 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP1P32455 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP1P32455 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP1P32455 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GBP1P32455 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GBP1P32455 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms