Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC8A1P32418 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC8A1P32418 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms