Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTX2P32243 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTX2P32243 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTX2P32243 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTX2P32243 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTX2P32243 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTX2P32243 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
OTX2P32243 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTX2P32243 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTX2P32243 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTX2P32243 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTX2P32243 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTX2P32243 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTX2P32243 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTX2P32243 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTX2P32243 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTX2P32243 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTX2P32243 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTX2P32243 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTX2P32243 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTX2P32243 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTX2P32243 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTX2P32243 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTX2P32243 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTX2P32243 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTX2P32243 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
OTX2P32243 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
OTX2P32243 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
OTX2P32243 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTX2P32243 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTX2P32243 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTX2P32243 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTX2P32243 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTX2P32243 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
OTX2P32243 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTX2P32243 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTX2P32243 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTX2P32243 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTX2P32243 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTX2P32243 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTX2P32243 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
OTX2P32243 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTX2P32243 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTX2P32243 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTX2P32243 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTX2P32243 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTX2P32243 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTX2P32243 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTX2P32243 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTX2P32243 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTX2P32243 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTX2P32243 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTX2P32243 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
OTX2P32243 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
OTX2P32243 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
OTX2P32243 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTX2P32243 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTX2P32243 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTX2P32243 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
OTX2P32243 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
OTX2P32243 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
OTX2P32243 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20■□□□□ 0.79
OTX2P32243 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTX2P32243 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
OTX2P32243 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
OTX2P32243 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTX2P32243 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTX2P32243 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX2P32243 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX2P32243 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX2P32243 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX2P32243 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX2P32243 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX2P32243 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX2P32243 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX2P32243 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTX2P32243 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX2P32243 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX2P32243 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX2P32243 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX2P32243 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX2P32243 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX2P32243 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX2P32243 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTX2P32243 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX2P32243 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX2P32243 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX2P32243 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX2P32243 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX2P32243 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX2P32243 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX2P32243 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX2P32243 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX2P32243 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX2P32243 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX2P32243 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX2P32243 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX2P32243 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX2P32243 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTX2P32243 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms