Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC3AP31941 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms