Protein–RNA interactions for Protein: P31358

CD52, CAMPATH-1 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 61 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD52P31358 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD52P31358 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD52P31358 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CD52P31358 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD52P31358 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CD52P31358 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD52P31358 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD52P31358 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD52P31358 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD52P31358 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD52P31358 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD52P31358 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD52P31358 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD52P31358 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD52P31358 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD52P31358 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD52P31358 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CD52P31358 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD52P31358 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD52P31358 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD52P31358 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD52P31358 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD52P31358 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD52P31358 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD52P31358 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD52P31358 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD52P31358 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD52P31358 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD52P31358 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD52P31358 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD52P31358 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CD52P31358 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD52P31358 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD52P31358 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD52P31358 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD52P31358 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD52P31358 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD52P31358 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD52P31358 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CD52P31358 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CD52P31358 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD52P31358 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD52P31358 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD52P31358 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD52P31358 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD52P31358 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD52P31358 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD52P31358 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD52P31358 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD52P31358 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD52P31358 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD52P31358 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD52P31358 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD52P31358 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CD52P31358 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD52P31358 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD52P31358 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD52P31358 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD52P31358 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD52P31358 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD52P31358 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD52P31358 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD52P31358 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD52P31358 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD52P31358 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD52P31358 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD52P31358 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD52P31358 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD52P31358 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD52P31358 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD52P31358 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD52P31358 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD52P31358 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD52P31358 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD52P31358 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD52P31358 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CD52P31358 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD52P31358 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD52P31358 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD52P31358 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CD52P31358 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD52P31358 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD52P31358 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD52P31358 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD52P31358 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD52P31358 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CD52P31358 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD52P31358 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD52P31358 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD52P31358 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD52P31358 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD52P31358 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD52P31358 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD52P31358 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD52P31358 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD52P31358 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD52P31358 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD52P31358 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD52P31358 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD52P31358 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms