Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND2P30279 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND2P30279 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND2P30279 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCND2P30279 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND2P30279 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND2P30279 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND2P30279 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND2P30279 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND2P30279 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND2P30279 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND2P30279 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND2P30279 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND2P30279 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND2P30279 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND2P30279 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND2P30279 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND2P30279 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCND2P30279 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND2P30279 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND2P30279 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND2P30279 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND2P30279 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND2P30279 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND2P30279 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND2P30279 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND2P30279 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND2P30279 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCND2P30279 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND2P30279 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND2P30279 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND2P30279 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND2P30279 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND2P30279 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND2P30279 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND2P30279 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND2P30279 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND2P30279 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND2P30279 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND2P30279 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND2P30279 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND2P30279 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND2P30279 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCND2P30279 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND2P30279 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND2P30279 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND2P30279 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND2P30279 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND2P30279 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND2P30279 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND2P30279 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND2P30279 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND2P30279 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND2P30279 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND2P30279 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND2P30279 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCND2P30279 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND2P30279 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND2P30279 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND2P30279 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND2P30279 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND2P30279 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND2P30279 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND2P30279 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND2P30279 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCND2P30279 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND2P30279 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND2P30279 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND2P30279 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND2P30279 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND2P30279 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND2P30279 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND2P30279 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND2P30279 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND2P30279 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND2P30279 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCND2P30279 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND2P30279 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND2P30279 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND2P30279 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND2P30279 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND2P30279 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND2P30279 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND2P30279 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND2P30279 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND2P30279 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND2P30279 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND2P30279 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND2P30279 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCND2P30279 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND2P30279 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND2P30279 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND2P30279 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND2P30279 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND2P30279 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND2P30279 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND2P30279 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND2P30279 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND2P30279 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCND2P30279 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms