Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC27P30260 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC27P30260 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC27P30260 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC27P30260 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC27P30260 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC27P30260 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC27P30260 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC27P30260 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC27P30260 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC27P30260 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC27P30260 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC27P30260 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC27P30260 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC27P30260 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC27P30260 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC27P30260 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC27P30260 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC27P30260 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC27P30260 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC27P30260 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC27P30260 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC27P30260 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC27P30260 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC27P30260 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC27P30260 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC27P30260 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC27P30260 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC27P30260 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC27P30260 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC27P30260 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC27P30260 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC27P30260 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC27P30260 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC27P30260 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC27P30260 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC27P30260 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC27P30260 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC27P30260 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC27P30260 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC27P30260 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC27P30260 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC27P30260 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC27P30260 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC27P30260 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC27P30260 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC27P30260 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC27P30260 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC27P30260 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC27P30260 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC27P30260 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDC27P30260 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC27P30260 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC27P30260 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC27P30260 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC27P30260 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC27P30260 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC27P30260 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC27P30260 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC27P30260 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC27P30260 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC27P30260 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC27P30260 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC27P30260 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC27P30260 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC27P30260 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC27P30260 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC27P30260 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC27P30260 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC27P30260 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC27P30260 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC27P30260 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC27P30260 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC27P30260 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC27P30260 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC27P30260 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC27P30260 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC27P30260 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC27P30260 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC27P30260 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC27P30260 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC27P30260 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC27P30260 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC27P30260 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC27P30260 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC27P30260 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC27P30260 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC27P30260 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC27P30260 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC27P30260 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC27P30260 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC27P30260 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC27P30260 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC27P30260 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC27P30260 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC27P30260 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC27P30260 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC27P30260 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC27P30260 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC27P30260 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms