Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECHS1P30084 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ECHS1P30084 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms