Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPHB2P29323 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EPHB2P29323 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EPHB2P29323 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB2P29323 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB2P29323 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB2P29323 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPHB2P29323 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms