Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNFRSF8P28908 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFRSF8P28908 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms